Die am Markt befindlichen RTV-1 Dichtstoffe sind weitestgehend fungizid (pilzhemmend) ausgerüstet, doch auch diese unterliegen einer natürlichen Abnützung die zu Schimmelbefall führt. Unterschieden wird zwischen Primärbefall – die Schimmelspore muss einen verwertbaren Nährstoff vorfinden, was bei Dichtstoffen nicht möglich ist – und Sekundärbefall – der Schimmelpilz ist bereits im Dichtstoff verankert.
Primärbefall, nicht der Dichtstoff schimmelt, sondern auf der Oberfläche abgelagerte Schmutzstoffe. Der Befall zeigt sich durch gelbe oder schwarze Punkte auf der Oberfläche die durch Anwendung chlorhaltiger Reinigungsmittel effektiv entfernt werden können.
Sekundärbefall, die gesamte Verfugung muss entfernt werden. Vor der erneuten Verfugung mit einem (zwingend) fungizid eingestellten Dichtstoff sind die nähere Umgebung und die Halteflächen zu desinfizieren.
Die Ursachen für Schimmelbildung sind mit diesen Maßnahmen nicht beseitigt. Ausreichende Belüftung und Trockenheit sind Voraussetzung um erneute Schimmelbildung auszuschließen. Sind diese Voraussetzungen nicht gegeben ist es eine Frage der Zeit, bis der Schimmelpilz wieder zu sehen ist.